Treffer: BioInfoWF – WEB SERVICES AND WEB INTERFACES GENERATOR FOR BIOINFORMATICS ANALYSIS ; BioInfoWF – СИСТЕМА АВТОМАТИЧЕСКОЙ ГЕНЕРАЦИИ WEB-ИНТЕРФЕЙСОВ И WEB-СЕРВИСОВ ДЛЯ БИОИНФОРМАЦИОННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ

BioInfoWF – WEB SERVICES AND WEB INTERFACES GENERATOR FOR BIOINFORMATICS ANALYSIS ; BioInfoWF – СИСТЕМА АВТОМАТИЧЕСКОЙ ГЕНЕРАЦИИ WEB-ИНТЕРФЕЙСОВ И WEB-СЕРВИСОВ ДЛЯ БИОИНФОРМАЦИОННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ

M. A. Genaev, E. G. Komyshev, K. V. Gunbin, D. A. Afonnikov, М. А. Генаев, Е. Г. Комышев, К. В. Гунбин, Д. А. Афонников

Министерство образования и науки РФ

Vavilov Journal of Genetics and Breeding; Том 16, № 4/1 (2012); 849-857 ; Вавиловский журнал генетики и селекции; Том 16, № 4/1 (2012); 849-857 ; 2500-3259

Institute of Cytology and Genetics of Siberian Branch of the RAS

2014

Vavilov Journal of Genetics and Breeding / Вавиловский журнал генетики и селекции

Web-сервис, data integration, workflow data processing, data metadescription, Web interface, Web service, интеграция данных, конвейерная обработка данных, метаописание данных, Web-интерфейс

Fachzeitschrift article in journal/newspaper

application/pdf

Russian

https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/83/84; Гунбин К.В., Генаев М.А., Турнаев И.И., Афонников Д.А. Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков: анализ эволюции циклинов B // Вестн. Томского гос. ун-та. Биология. 2011. 4. С. 175–189.; Bhagat J., Tanoh F., Nzuobontane E. et al. BioCatalogue: a universal catalogue of Web services for the life sciences // Nucl. Acids Res. 2010. V. 38. Р. 689–694.; Deelman E., Gannon D., Shields M., Taylor I. Workfl ows and e-Science: An overview of workfl ow system features and capabilities // Future Generation Computer Systems. 2009. V. 25. Р. 528–540.; Dereeper A., Guignon V., Blanc G. et al. Phylogeny.fr: robust phylogenetic analysis for the non-specialist // Nucl. Acids Res. 2008. V. 36. Р. 465–469.; Fernald G.H., Capriotti E., Daneshjou R. et al. Bioinformatics challenges for personalized medicine // Bioinformatics. 2011. V. 27. Р. 1741–1748.; Goble C.A., Bhagat J., Aleksejevs S. et al. myExperiment: a repository and social network for the sharing of bioinformatics workfl ows // Nucl. Acids Res. 2010. V. 38. Р. 677–682.; Goecks J., Nekrutenko A., Taylor J., Galaxy: a comprehensive approach for supporting accessible, reproducible, and transparent computational research in the life sciences // Genome Biol. 2010. 11:R86.; Gunbin K.V., Suslov V.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A. Computer system for analysis of molecular evolution modes (SAMEM): analysis of molecular evolution modes at deep inner branches of the phylogenetic tree // In Silico Biol. 2012. In press.; Gunbin K.V., Suslov V.V., Turnaev I.I. et al. Molecular evolution of cyclin proteins in animals and fungi // BMC Evol. Biol. 2011. V. 11. P. 224.; Hartmann A., Czauderna T., Hoffmann R. et al. HTPheno: an image analysis pipeline for high-throughput plant phenotyping // BMC Bioinformatics. 2011. V. 12. P. 148.; Moore J.H., Asselbergs F.W., Williams S.M. Bioinformatics challenges for genome-wide association studies // Bioinformatics. 2010. V. 26. Р. 445–455.; Oinn T., Addis M., Ferris J. et al. Taverna: a tool for the composition and enactment of bioinformatics workfl ows // Bioinformatics. 2004. V. 20. Р. 3045–3054.; Pop M., Salzberg S.L. Bioinformatics challenges of new sequencing technology // Trends Genet. 2008. V. 24. Р. 142–149.; Pupko T., Pe’er I., Hasegawa M. et al. A branch-and-bound algorithm for the inference of ancestral amino-acid sequences when the replacement rate varies among sites: Application to the evolution of fi ve gene families // Bioinformatics. 2002. V. 18. Р. 1116–1123.; Sánchez R., Serra F., Tárraga J. et al. Phylemon 2.0: a suite of Web-tools for molecular evolution, phylogenetics, phylogenomics and hypotheses testing // Nucl. Acids Res. 2011. V. 39. Р. 470–474.; Smith N.G. Are radical and conservative substitution rates useful statistics in molecular evolution? // J. Mol. Evol. 2003. V. 57. Р. 467–478.; Zhang J. Rates of conservative and radical nonsynonymous nucleotide substitutions in mammalian nuclear genes // J. Mol. Evol. 2000. V. 50. Nо. 1. P. 56–68.; https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/83

https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/83

Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). ; Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access).

edsbas.B92B21E4

BASE